2022-12-31 上海本轮监测到30个奥密克戎亚型毒株

上海最新监测到的XBB.1.5毒株，已在美国强势崛起。其显著的增长优势，归功于新突变大大增强了它与ACE2（新冠病毒受体）的结合，还可能使其获得更多突变。

近日，全球共享所有流感数据倡议（GISAID）数据库新增369条中国本土新冠病毒测序结果，上传者为上海交通大学医学院附属瑞金医院（以下简称“上海瑞金医院”）陈赛娟与上海市公共卫生临床中心（以下简称“上海公卫中心”）范小红领衔的联合科研攻关团队。

澎湃科技记者获悉，这些样本来自上海地区新冠患者，随机采集于今年11月23日至12月22日，经基因测序确认30个已知奥密克戎亚型毒株，尚未发现新的新冠病毒变异株。除了“南方株”BA.5.2和“北方株”BF.7相会于上海，在欧美广泛流行的BQ.1家族和XBB家族占比超过1/3——这些病例绝大多数为境外输入病例，处于闭环单独管理中，因此并未造成BQ.1家族和XBB家族的本土大规模传播。

上海近期新冠病毒基因测序结果。来源：上海交通大学医学院

未出现新的新冠病毒变异株

据上海瑞金医院官方通报，为了评估调整疫情防护措施之后白熊资讯网奥密克戎毒株在境内的传播模式，上述研究团队分析了当前境内流行的奥密克戎亚型种类。研究论文《初步分析我国2022年秋冬新冠疫情中奥密克戎亚型多样性与流行病学特征》（Primary assessment of the diversity of Omicron sublineages and the epidemiologic features of autumn/winter 2022 COVID-19 wave in Chinese mainland）发表在《Frontiers of Medicine》上。

研究人员对2022年秋冬期间上海公卫中心收治的患者中随机抽取的378例样本进行基因组测序，获得369个高质量新冠病毒全基因组序列。分子进化树分析发现，这些病毒基因组中共包含GISAID数据库里记录的30个奥密克戎亚型毒株，其中355个（95.95%）基因组序列集中在5个奥密克戎亚系，主要毒株包括已报道在北京和广州等地流行的BF.7和BA.5.2和近期欧美地区出现的BQ.1和XBB。结合感染者的旅行史和感染接触史，证明有北京或广州疫情接触史者分别主要携带BF.7和BA.5.2亚株；从海外入境上海的感染者主要携带BQ.1和XBB；而上海本地感染者中除了BA.5.2以外，还有多个奥密克戎亚株相对占比较高。这些结果中尚未发现新的新冠病毒变异株。

新冠病毒的突变和进化。来源：Daniele Focosi

BQ.1和XBB是目前欧美流行度最高的两个突变株家族。BQ.1是奥密克戎BA.5变异产生的第六代亚分支，其子系BQ.1.1已经成为全球主要流行株。而作为两个奥密克戎BA.2后代突变株的重组体的XBB，有极强的免疫逃逸能力，在出现后短短两周内就在新加坡成为主要流行株白熊资讯网。二者在欧美广泛流行，上升趋势显著。BA.5.2和BF.7（BA.5.2.1.7的缩写）也均属于BA.5亚分支。据新加坡《联合早报》12月30日报道称，新加坡本地数据科学研究团队分析了GISAID数据库收集的中国新一波疫情期间的病毒基因组序列（来自北京、福建、广州、内蒙古和四川），并与数据库里的1440万个序列进行比较，发现它们和今年7月至12月在全球各地传播的已知毒株有着密切关系，表明中国至今并未出现新的新冠毒株。

澎湃科技记者获悉，此次上海研究团队测序的369个病例，目前无一例重症，有症状的发热病人，也未检查出任何血常规或炎症指标的异常。整体观察来看，BA.5.2和BQ.1症状相对更轻，BF.7的有症状比例略高。

12月26日，中国疾控中心病毒所所长许文波接受央视采访时称，自12月1日至26日，全国已完成1142//www.czybx.com例病例的全基因组测序，提示BA5.2和BF.7占全国流行的绝对优势，两者合计超过80%，此外还有7个奥密克戎变异株亚分支在全国流行，这些亚型没有发现有特征性的基因组突变。同时，一共发现31个奥密克戎亚分支输入国内，其中也包括正在国外加速传播的BQ.1、XBB等亚分支。

“新毒株的致病力和其他毒株没有明显区别，目前暂没有发现BQ.1和XBB在国内外引起重症和死亡增加的报道。”在12月20日的国务院联防联控机制新闻发布会上，许文波表示，近三个月以来，一共有130多个奥密克戎的亚分支输入我国，其中9个省检出BQ.1及其亚分支，3个省检出XBB亚分支。他当时指出，BQ.1和XBB在国内尚未形成优势传播，但其传播优势会逐渐增加，与目前的国内主流毒株BA.5.2和BF.7一起，加上其他50多个输入的亚分支，最终可能形成一个共循环。

新冠病毒进化路线图。来源：Rodrigo Quiroga

XBB.1.5来势汹汹

值得关注的是，上海此次监测到的25例XBB家族中，有3例XBB.1.5，同样都是境外输入病例，未造成本土传播。研究人员表示，境外输入患者中的毒株较为复杂，多为在我国境内首次检测到。当前测序结果表明，针对境外输入新型病毒株较多，仍需要常白熊资讯网规开展病毒株检测为后续的科学防控提供依据。

在美国，XBB.1.5已迅速成为头号流行毒株。美国疾控中心最新数据显示，近两周来，XBB.1.5在美国强势崛起，已取代BQ.1.1和BQ.1的优势地位。本周（12月25日至31日）XBB.1.5预计占美国新冠病例的40.5%，比前一周（21.7%）几乎翻一番。

最新研究显示，XBB.1.5的免疫逃逸能力与 XBB.1相当，但关键突变F486P使其具有更高的人ACE2受体结合亲和力——ACE2可以被看作是新冠病毒进入人体细胞的“大门”，这意味着XBB.1.5更容易感染人体。试验表明，在至少接种两剂mRNA疫苗的情况下，突破感染BF.7也无法诱导对XBB.1和XBB.1.5的高水平中和抗体，难以防止再感染。

国内外专家预计，XBB.1.5将会在短时间内成为全世界的主要毒株，需要密切关注。其中还有一个重要原因是，XBB.1.5 的人ACE2结合亲和力几乎与 BA.2.75 相当，可能使 XBB.1.5 未来像BA.2.75一样获得更多突变，不过XBB.1.5目前免疫压力不大，还不会很快进化。

美国每周监测新冠毒株比例图。来源：美国疾控中心官网

12月24日，美国斯克里普斯研究转化研究所创始人兼所长埃里克托波尔（Eric Topol）就在个人博白熊资讯网客中提出“预警”：XBB.1.5“正处于井喷式增长”。他不无担忧地指出，该突变株最早在纽约州被监测到，而当地住院人数（尤其是老年人）也随之急剧上升。

“当然，其他因素也可能导致这一结果，如免疫力下降、更频繁的室内聚会、寒冷天气、缺乏缓解措施等，我们不知道XBB.1.5在多大程度上推动了这一进程，但这看起来不妙。它至少做出了贡献，看到两个数据如此惊人的共同增长也太巧合了。”托波尔写道，“未来几周，XBB占主导的相邻州的住院情况将如何发展，只有时间能告诉我们答案。”

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